Természetes biológiai folyamatként lehet családi örökletes jellegű, genetikai, főleg kromoszomális eredetű, vagy okozhatja autoimmun betegség is, amelyben a petefészket ellenanyagok károsítják. Amerikai tanulmányok szerint a rendszeresen és erősen dohányzó nőknél, a gyermeket nem szült nőknél és „a gyertyát a két végén égető” típusú életmódot folytató nőknél is gyakori a 40 éves kor előtt bekövetkező menopauza.
Ha természetes úton következik be a korai menopauza, a szervezetben jellemzően kevés ösztrogén található, míg az FSH, a follikuláris stimuláló hormon mennyisége magasabb, de hiába hat a petefészekre, nem képes kiváltani a tüszőérést és ovulációt. A havivérzés elmaradásán túl a korai menopauzás nőkben a menopauza további tünetei is gyakran jelentkeznek és általában erősebbek, mint az átlag nőknél.
Azoknál a nőknél, akik még szeretnének gyermeket szülni, de korai menopauzásak, igen hasznos lehet a teljes fizikális kivizsgálás, a vérvizsgálat és a hormonvizsgálat. Vérvizsgálattal tudják kimutatni, hogy a belső elválasztású (endokrin) mirigyeket károsító ellenanyag jelen van-e a szervezetben, mivel annak jelenléte autoimmun betegségre utal. 35 éven aluli nőknél kromoszómavizsgálatot is végeznek, annak céljából, hogy megerősítsék, hogy a nő genetikailag is valóban nő.
A művi beavatkozás, amelynek hatásaként kialakul a menopauza, lehet a petefészkek és a méh együttes eltávolítása, vagy külön-külön valamelyik eltávolítása. Az emlőrák műtéten átesett nőknél a műtét után megelőzésképpen szükség van hormonális beavatkozásra a szervezetbe, ilyenkor mesterséges menopauzát hoznak létre, mivel az ösztrogén hormon elősegíti a mellrák kiújulását.
A menopauza tüneteinek kialakulása ösztrogénpótló kezeléssel előzhető meg, vagy fordítható vissza. Ezzel ugyanakkor a korai menopauzás nők gyermekvállalási esélyei nem nőnek, az mindössze 10 %-nyi. Donor petesejt beültetése esetén – más nőből kivett petesejtet ültetnek a korai menopauzás nő méhébe – a terhesség bekövetkezésének valószínűsége már magasabb, 50 %-os. A beültetés előtt a nő ösztrogén- és progeszteron kezelésben részesül, hogy az így előidézett mesterséges menstruációs ciklus mintegy felfrissítse a méh nyálkahártyáját és ezáltal a megtermékenyült pete méhnyálkahártyába történő beágyazódása biztos legyen.